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英木和

总RNA测序

利用TruSeq Stranded Total RNA试剂盒开展的总RNA测序(全转录组分析)可得到最完整的转录组图像,包括编码RNA和多种形式的非编码RNA。它可实现高度灵敏且准确的表达定量,以及鉴定转录组中已知的和新的特征。


Ribo-Zero试剂盒?#31579;?#25928;去除高丰度的RNA种类,同?#21271;?#30041;片段化和完整的转录本从而用于文库构建。总RNA测序(total RNA-Seq)在正常和低质?#24247;腇FPE样品中都能够实?#32959;?#20339;覆盖。


总RNA测序的优点:
Total RNA-Seq分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,从而提供对转录组的全面视图。
鉴定已知的和新的转录特征
使?#33455;?#20154;员能够在最广泛的转录本中鉴定生物标志物
可实现对感兴趣的表型更加全面的了解
允许在很宽的动态范围内分析转录组
mRNA测序
mRNA测序(mRNA-Seq)已迅速成为分析疾病?#32431;觥?#29983;物过程及广泛?#33455;可?#35745;中的转录组的首选方法。mRNA-Seq不仅可提供极为准确且高灵敏度的量化基因表达,还可识别已知的和新的转录异构体、基因融合和其他特征及等位基因特异性表达。mRNA-Seq可提供编码转录组的完整视图,而并不受限于先验知识。


mRNA测序的优势
与基因表达芯片相比,mRNA-Seq在分析转录组方面具有诸多优势。
该方法适用于更广泛的动态范围,不仅可增加灵敏度,还可提高基因表达中测?#24247;?#20493;数变化的准确性。
可捕获已知特征和新发特征
可广泛应用于众多物种


靶向RNA测序

靶向RNA测序是一种测定感兴趣转录本表达的高度准确且特异的方法,同时提供定量和定性信息。能实现表达分析鉴定融合基因。Illumina为特定RNA测序提供预制和定制两种方案。


这种方法的应用包含:
选定特定基因的表达谱分析,以评估疾病相关的变异和表观遗传学改变
基因融合和基因表达变化分析以提供癌症中功能相关的改变的特定视角
?#33455;?#21253;括NFkB,P450及细胞凋亡等在内的各种信号转导通路相关的基因


靶向RNA测序的优势
设计靶向的RNA表达集合,重点关注感兴趣的RNA序列,或添加定制内容到全面优化且经过实验验证的基因集合。
为测定感兴趣的转录本提供一种高度准确而特异的方法
利用定性和定量信息来实现差异表达分析、等位基因特异的表达测定和融合基因验证
同时测定数十个至数千个靶点
兼容低质量或FFPE来源的RNA样品


小RNA测序

随着新一代测序的不断发展以及Illumina惊人的数据通量和多重分析能力,基于测序的小RNA分析方法被迅速采用,以便在转录和转录后水平?#33455;?#22522;因调控。小RNA测序技术具有前所未有的灵敏度和动态范围,可同时对数以千计的小RNA和miRNA进行检测,适合探索小RNA和图谱分析应用。


利用小RNA测序技术,无需预先假设,?#32431;?#21457;?#20013;?#30340;microRNA,以单碱基分辨?#22987;?#23450;变异(如isomirs),并可分析任何样品中所有小RNA的差异表达。TruSeq Small RNA Library Prep Kit支持在17-35 bp范围内的自主完成片段筛选,以检测不同样品之间小RNA的差异表达。


小RNA测序的优势
直接从总RNA生成miRNA测序文库,以便了解非编码RNA的作用。
了解转录后调控如?#26410;?#25104;表型
鉴定新颖的生物标志物
捕获完整的小RNA和miRNA


超低起始样本与单细胞RNA测序

采用高度灵敏的RNA测序(RNA-Seq)方法,现在可实?#27542;?#20302;起始样本量、甚至单细胞的基因表达分析。单细胞测序是用来检测个别细胞的基因组或转录组的方法,能以高分辨率?#20801;?#32454;胞之间的不同变异。


使用超低起始样本与单细胞RNA-Seq,您可以探索一个器官或肿瘤中不同细胞的独特生物形态,并了解对各环境因素的亚群反应。这些方法都有利于生物学家在分化、增殖、肿瘤形成等时间依赖的过程中?#33455;?#32454;胞功能和异质性。


超低起始样本与单细胞RNA测序的优势
超低起始样本与单细胞RNA测序是一个功能强大的工具,可以用来从最小?#24247;?#36215;?#30142;?#26009;中?#33455;?#25972;个转录组(包括剪接点和选择性剪接)。
简单的样本制备 — 可在整个细胞?#29616;?#25509;操作的单管操作流程,有助于保留样本的完整性
无可比拟的灵敏度 — 以单细胞或10 pg的总RNA(输入范围:1–1,000个细胞或10 pg–10 ng的总RNA)作为起始模板
高质?#24247;腞NA-Seq数据 — 可保留全长基因信息、低比例的rRNA片?#25105;?#21450;高表达的高GC含量转录本。


核糖体分析

核糖体分析是一种对核糖体保护的mRNA片段进行深度测序的方法。这些片段的纯化和测序提供了在特定时间点细胞内活跃的核糖体的“快照”。这一信息可确定细胞中哪些蛋?#23383;?#27491;在积极翻译。
 
核糖体分析实现了细胞翻译过程的系统监测以及蛋?#23383;?#20016;度的预测。确定哪些区域的信息?#29615;?#35793;可帮助定义复杂生物体的蛋?#23383;首欏?#19982;Illumina的大规模并?#23567;?#39640;通?#24247;?#27979;序相结合,核糖体分析带来了准确而详尽的蛋?#23383;?#29983;成体内分析。


核糖体分析的优势
识别正在翻译的转录本,以发现基因调控的重要信息。
?#33455;?#32763;译控制,测定基因表达
识别翻译起始位点
确定蛋白合成速率
预测蛋白丰度


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