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英木和

近水楼台先得月:IMH最新推出Illumina甲基化芯片与甲基化测序服务
2017-08-23

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IMH是Illumina在中国最大的代理商,而且是Illumina在全球为数不多的“精英渠道伙伴”之一。我?#19988;?#36830;续四年获得Illumina颁发的年度杰出销售成就奖。IMH不仅是专业的基因技术代理销售平台,而且从成立之初就致力于为客户提供从实验室设计、技术选择到人员培训等基因技术领域的整体化解决方案。目前,我们正积极向大健康领域拓展业务,最新推出表观遗传学技术服务,包括Illumina甲基化芯片与甲基化测序服务


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DNA甲基化是基因组中一种重要的化学修饰,调节基因的表达与沉默,和发育、衰老,以及癌症等许多疾病密切相关,是表观遗传学?#33455;?#30340;重要内容之一。

Ilumina开发了多种基于芯片和基于测序的表观遗传分析工具,可为专注于表观遗传修饰及其对基因调控之影响的?#33455;?#20154;员提供功能强大、简单易用且经济高效的解决方案。


甲基化芯片技术服务

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850K甲基化芯片的特点与优势
依托业界领先的Infinium实验分析方法,Illumina推出了新一代的DNA甲基化芯片——MethylationEPIC BeadChip,可基于单核苷酸分辨率定量检测人类全基因组中853,307个甲基化位点(简称850K芯片)。850K芯片涵盖了90%以上的Infinium HumanMethylation450K芯片的位点内容;不但保持了对CpG岛、基因启动子区的全面覆盖,还特别加强了增强子区(新增333,265个来自ENCODE及FANTOM5的探针)以及基因编码区的探针,是目前最适合表观基因组全关联分析?#33455;?EWAS)的DNA甲基化芯片。


  • 全面的全基因组覆盖范围(> 850,000个甲基化位点)
    包括CpG岛、非CpG和差异甲基化位点、FANTOM5增强子、ENCODE染色质、ENCODE转录因子结合位点、miRNA启动子区域等
  • 技术性重复重?#20013;?gt;98%
  • 可适用于FFPE样本
  • DNA起?#21058;康?#33267;250 ng

数据分析
IMH提供850K甲基化芯片的基础分析和可定制的高级分析。基础分析包括原始数据预处理,数据归一化,差异甲基化位点及其在染色体上的分布,启动子区甲基化分析,按基因注释分类和CpG注释分类的差异甲基化区域,差异甲基化位点注释基因的GO分类和KEGG分析等。可定制的高级分析包括甲基化与表达谱的关联分析,不同基因区段的甲基化水?#22870;?#21270;分析,差异甲基化基因中邻近启动子区域motif的识别,特定样本中高甲基化和低甲基化位点的筛选等。


甲基化测序技术服务

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甲基化测序的特点和优势
胞嘧啶甲基化可能明显改变基因的时空表达和染色质重塑。全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)利用新一代测序(NGS)和全基因组分析的力量,提供整个基因组甲基化模式的单碱基分辨率全面视图。


Illumina为甲基化测序提供了一个全面支持的、从文库制备到数据分析的流程。在文库制备过程中,重亚硫酸盐将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶。转化后的碱基在测序中被识别为胸腺嘧啶(PCR后),并通过序列计数来确定甲基化胞嘧啶的比例。


  • 可发现整个基因组中所有CpG、CHH和CHG区域的甲基化模式
  • 能以少量的DNA捕获全面的样品多样性
  • 能查看大多数物种基因组中几乎每个胞嘧啶的甲基化
  • DNA起?#21058;康?#33267;50 ng


数据分析
IMH提供全基因组甲基化测序的基础分析和可定制的高级分析。基础分析包括测序数据预处理,转化效?#21183;?#20272;,全基因组比对,CpG/CHG/CHH位点覆盖率、测序深度、甲基化比例和染色体分布, 差异甲基化位点和甲基化区段筛选, 差异甲基化位点或区段的CpG岛注释和基因注释,全基因组甲基化图谱,甲基化和表达谱的联合分析,GO和KEGG分析等。高级分析将根据用户的?#33455;?#38656;求进行个性化定制。

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